Тренинговый компонент
Проект 53 ЕС ЦПО ХБРЯ поддерживает Казахстан путем проведения технической подготовки специалистов

С 17 по 21 декабря 2018 года в Службе общественного здравоохранения Англии (PHE), Портон-Даун, Великобритания, состоялась серия трех кратких учебных курсов.   Тренинг предназначался для ученых из Казахстана, представляющих два института Алматы (Центральную референтную лабораторию Национального центра биотехнологии (НЦБ), Казахский научный центр карантинных и зоонозных инфекций (КНЦКЗИ)) и два учреждения Астаны (Центр дозорного эпидемиологического надзора за гриппом и Национальную референс-лабораторию по вирусным инфекциям).

Профессор Кристофер Х. Лог и Деларам Ахавейн из обучающей группы по новым и опасным патогенам (NADP) провели однодневный тренинг по использованию и обслуживанию гибких пленочных изоляторов. Гибкие пленочные изоляторы предоставляют ученым возможность работать в безопасной и изолированной среде с образцами, предположительно содержащими опасные патогены, такие как геморрагическая лихорадка Крым-Конго или возбудитель сибирской язвы. Это те же типы изоляторов, которые использовались PHE в Западной Африке для борьбы со вспышкой Эболы в 2014 году.

Двухдневный практический лабораторный учебный курс проводился после тренинга по использованию и обслуживанию гибких пленочных изоляторов и фокусировался на вопросах инактивации инфекционных веществ и ПЦР-диагностики в реальном времени циркулирующих патогенов, таких как вирус клещевого энцефалита.

В дополнение к техническому обучению, Oxford Nanopore организовали двухдневный учебный курс по нанопоровому секвенированию при помощи устройства minION. Это позволило ознакомиться с передовым опытом работы с большим количеством образцов при использовании новейшей технологии прибора minION, портативного устройства для генного секвенирования, схожего по размеру с плиткой шоколада.

Результаты обучения позволят подготовленным казахстанским ученым безопасно и изолированно инактивировать особо опасный микробиологический материал, провести молекулярную диагностику потенциально опасных образцов на наличие патогенов, а затем выполнить полногеномное секвенирование любых выявленных патогенов, а также метагеномное секвенирование. Теперь ученые смогут применять знания, полученные в ходе этого курса, в программах своих учреждений по общественному здравоохранению и надзором за болезнями.